队列的合理配置是战斗胜负的关键因素之一。前中后三排的舰船分工明确，前排以高防御的坦克型舰船为主，例如装甲型护卫舰或驱逐舰，承担吸收火力的职责；中排配置高爆发输出的舰船，如狙击型巡洋舰或导弹驱逐舰，负责快速压制敌方核心目标；后排则需部署具备控制或逆转战局能力的舰船，例如搭载电子干扰系统的航母或具备范围伤害的战列巡洋舰。这种分层结构能有效应对大多数战斗场景，但需根据敌方阵容动态调整。
工程舰的编组直接影响资源获取效率，例如将多功能工程舰与小型工程舰混合编队可提升单次采集容量，而中型工程舰搭配载货型舰船能进一步缩短往返时间。战斗队列的维护成本需依赖稳定的资源供给，因此建议将至少60%的舰队人口分配给工程舰，优先升级金属与晶体采集能力。采矿平台的建设需选择高密度资源点，并通过蓝图研究强化工程舰的仓库扩容与采集加速技能。
每艘舰船拥有5-7个可改装配件系统，前排舰船应优先提升护甲值与闪避率，中排舰船侧重武器冷却与暴击率，后排舰船则需强化能量回复与射程。特殊子型号舰船往往具备战略价值，例如谷神星级支援型驱逐舰的治疗能力，或星云追逐者脉冲炮艇的无视护甲特性。技术点分配需专注主型号舰船，避免分散投资导致战力稀释。
在小行星稀疏区作战时，需减少巡洋舰以上大型舰船占比，改用机动性更强的护卫舰群；高能辐射区则适合部署战列舰等重型单位以规避小型舰骚扰。伏击战术要求舰队配备隐身侦察舰与高机动突击舰，而据点防守需配置防空型护航艇与范围治疗舰。联盟协同作战时，各成员舰队应按功能互补原则分工，避免重复配置导致的资源浪费。
新赛季初期应快速提升基地至4本，解锁中型工程舰与关键防御建筑，舰队以护卫舰与驱逐舰为主力。中期需通过盟友协作占领高级矿点，逐步替换为巡洋舰为核心的混合编队。后期大规模会战前，必须完成航母或战列舰的蓝图研究，同时储备足够重氢资源应对消耗战。整个过程中需保持工程舰与战斗舰的比例平衡，避免资源链断裂。
